由于南京博物院属于省属单位，而侵华日军南京大屠杀遇难同胞纪念馆不属于博物馆范畴，因此，这次公示的一级博物馆名单中，南京的博物馆相当于吃了个“鸭蛋”。对于这个结果，南京市文化局博物馆处处长王兴平也有些惊讶，“市博和太博都没有入选的确有些意外。”据了解，按照国家文物局原来的想法，首批一级博物馆只有30多个名额，“全国各地光博物馆就有2000多家，这次评级对象又加上了纪念馆，再算上肯定入选的国字号和省级博物馆，剩下的名额已经很少了。”经过协调，首批一级博物馆的数量提高到79家，在申报过程中，南京一共申报了3家，但除了侵华日军南京大屠杀遇难同胞纪念馆入选外，南京市博物馆和太平天国历史博物馆双双落马。

    王兴平介绍，从之前公布的评分标准来看，市博和太博都符合一级馆标准，入围的希望很大。“市博馆藏文物多达10万件，这个数字即便在全国也名列前茅；太博是全国收藏太平天国文物最多、史料最丰富的研究机构，在该领域具有唯一性。”既然如此，为何这两家最终都落选呢？王兴平说：“我们在藏品和公共服务方面没有问题，就公示结果看，国家文物局可能有突出博物馆特色和地区文化差别的考虑。”据了解，由中国早期现代化先驱张謇于1905年创办的南通博物苑，是中国最早的博物馆；扬州博物馆则有“双博馆”的特点——集中国雕版印刷博物馆和扬州博物馆于一体；苏州博物馆是由设计过卢浮宫博物馆的世界著名建筑大师贝聿铭“督造”的，这也是他首次在中国设计的博物馆，具有很高建筑价值。

    王兴平不无遗憾地说：“这次评上一级的博物馆，今后将得到国家文物局在财政、业务交流和人员培训等各方面的优先支持。错过这次，南京博物馆只能等到3年后重新参评了。